治療根據病因而定，結石可用震波碎石方法而去除，一般對結石7～15mm大小者較有效。在輸尿管中下段結石經保守治療（飲水、中藥等）后仍無效者應采用在膀胱鏡下逆行取石方法，有時結石影響腎功能或用上法不能成功者則需外科手術去除。常常需要同時使用抗生素，不少梗阻性腎病梗阻并不完全，但因繼發感染造成水腫，炎癥分泌物阻塞等可以使梗阻變得更明顯，經抗生素使用后，梗阻可以明顯好轉，但使用劑量及選擇用藥需依據培養及腎功能情況而加以調整。由腫瘤等原因引起者需應用化療或外科手術處理。梗阻后所出現的多尿等造成水、電解質等紊亂應及時予以糾正。