1.一般治療
臥床休息，加強營養，低鹽飲食，避免日光曝曬及預防接種，慎用各種藥物，以免誘發疾病活動，預防感染。
2.糖皮質激素
潑尼松，總量≤60mg，分次服用；病情控制，實驗室檢查基本正常后改為小劑量維持療法，須持續數年。重癥可用甲潑尼龍沖擊療法。注意血壓，必要時加用血管擴張劑。
3.免疫抑制劑
常用藥為環磷酰胺、硫唑嘌呤和甲氨蝶呤等。由于此類藥物對SLE的活動控制不如激素迅速，因此，不提倡作為治療SLE的單一或首選藥。環磷酰胺對各類SLE均有效，特別是嚴重腎臟損害如彌漫性增生性腎炎、中樞神經系統和肺損害，早期與激素聯合使用是降低病死率和提高生命質量的關鍵。有人認為環磷酰胺靜脈沖擊治療是減少腎纖維化、穩定腎衰竭的一種有效方法。多數學者認為在環磷酰胺靜脈沖擊治療的同時應強調采用大量輸入平衡液體，即水化療法，以求更加安全。SLE的藥物治療的過程中，要注意以下幾點：
（1）急性腎衰竭
當肌酐清除率<20ml/min時，可在甲潑尼龍沖擊獲得緩解后，再進行環磷酰胺沖擊。
（2）環磷酰胺（CTX）近2周內有過嚴重感染，或白細胞計數<4×109/L，或對環磷酰胺過敏，或2周內用過其他細胞等免疫抑制劑，重癥腎病綜合征表現，血清白蛋白<2g/L時，應慎用環磷酰胺。由于兒童SLE的發病高峰在11～15歲，因此，治療時應該考慮青春期發育的問題。目前，在狼瘡腎炎，應用CTX沖擊治療尿蛋白消失后可用硫唑嘌呤維持。
（3）甲氨蝶呤（MTX）與硫唑嘌呤可分別與激素聯合應用，對控制SLE的活動及減少激素應用量有較好的作用，但不適合于重癥狼瘡腎炎和中樞神經系統狼瘡的治療。
（4）環孢素（CsA）近年來，采用環孢素或霉酚酸酯治療狼瘡性腎炎。
4.對癥治療
關節癥狀應用非甾體抗炎藥，皮膚癥狀合并用羥氯喹。
5.其他
重癥可用靜脈注射免疫球蛋白（IVIG）、血漿置換術等。亦有應用CD34+細胞移植治療重癥SLE的報道。