染色體基數也可根據染色體組型分析來推斷。當組成基數的染色體從形態上或功能上可進一步分成小群時，則將各小群的染色體數稱為原始基數（basis），以b表示。
染色體基數和原始基數在多數生物中是一致的，但也有不一致的例子。
例如，Pteropsida的x=21-41，裸子植物的x=12，Magnoliaceae的x=19，蘭科的x=19，這些植物都具有較高的基數；而還陽參屬（Crepis）的x=3，4，5，Haplopappus的x=2，4，這些植物的染色體基數具有多樣性。
