枯草芽孢桿菌對水產養殖中的弧菌、大腸桿菌和桿狀病毒等有害微生物有很強的抑制作用,能分泌大量幾丁質酶,分解養殖池中的有毒有害物質,凈化水質,同時能分解池中的殘餌、糞便、 有機物等,具有很強的清理水中垃圾小顆粒的作用。枯草芽孢桿菌也被廣泛應用在飼料中，它具有較強的蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶活性，能促進飼料中營養素的降解，使水產動物對飼料的吸收利用更加充分。
枯草芽孢桿菌可以減少對蝦病害發生，可以大大提高對蝦產量，從而提高經濟效益，生物環保，刺激水產動物免疫器官的發育，增強機體免疫力；減少對蝦病害發生，明顯提高對蝦產量，從而提高經濟效益，凈化水質，無污染，無殘留。