實驗材料 大腸桿菌
試劑、試劑盒 PEGTEATP寡核苷酸誘變引物T4多核苷酸激酶EDTASSC
儀器、耗材 水浴鍋電泳儀培養箱
實驗步驟
1. 將一個單鏈噬菌體產生的噬斑轉移至含有1 ml 滅菌TY培養基的1.5 ml 微量離心管中,60℃溫育5 min,以殺滅細菌細胞,劇烈振蕩以釋放瓊脂中的噬菌體,離心2 min。
2. 將100 μl 上清轉移至1 L 的燒瓶,瓶中裝有100 ml 培養基,其中含0.25 μg/ml 的尿苷。
3. 加5 ml 處于對數生長中期的大腸桿菌培養液,于37℃劇烈 振搖培養6~18 h。
4. 以5 000 g 離心30 min,保留上清。
5. 確定噬菌體在ung-大腸桿菌對ung+大腸桿菌中的相對滴度。
4. 毎4體枳的上清加1體積的5×PEG/NaCl溶液以沉淀噬菌體,混勻,0℃溫育1 h。
6. 5 000 g 離心15 min,倒棄上清,在15 ml Corex管內用5 ml TE緩沖液溶解沉淀,在旋渦混合器上劇烈振蕩。
7. 將噬菌體溶液置冰上1 h,如上步再次離心以去除細胞碎片,再用酚抽提和乙醇沉淀單鏈噬菌體DNA,通過測260 nm 吸光值確定DNA濃度。
8. 在1.5 ml 微量離心管內加入下列試劑:
(1)20 μl 10×T4多核苷酸激酶緩沖液
(2)2 μl 10 mmol/l ATP
(3)突變的寡核苷酸(長15~20個核苷酸〉
(4)加水至20 μl
(5)2 U T4多核苷酸激酶
(6)37℃溫育60 min,加3 μl 100 mmol/l EDTA并加熱至70℃終止反應。
9. 加含尿嘧啶的單鏈環狀DNA模扳(通常為1 μg DNA溶解在1 μl 體積)至磷酸化的寡核苷酸中,加1.25 μl 20×SSC,充分混勻,離心5 s。
10. 將離心管放入一個盛有70 ℃水的500 ml 燒杯中,自然冷卻至室溫后離心5 s,置于冰上。
11. 加入下列試劑以形成雜交混合液:
(1)20 μl 5×聚合酶混合物
(2)2.5 U或T4 DNA聚合酶
(3)2 U T4 DNA連接酶
(4)加水至100 μl
(5)充分混勻,然后置于0℃5 min,室溫5 min,37℃2 h。
(6)最后加3 μl 500 mmol/l EDTA終止反應。
12. 取20 μl 在0.8%的瓊脂糖上電泳。對照泳道應包括單鏈環狀病毒DNA,雙鏈閉環DNA和帶切口的雙鏈壞狀DNA。
13. 根據電泳結 果估算DNA的量,用1~100 ng的雙鏈DNA產物轉化ung+大腸桿菌。
14. 選擇性地或隨機挑取所得克隆(噬斑或菌落)用以分離純的克隆原種。
15. 通過DNA序列測定對選出的克隆進行分析。