比較基因組研究結果表明基因復制在大多數研究的物種中都很常見。這可以通過人類 或果蠅的基因組中的可變拷貝數（拷貝數變異）來證明。但是，很難衡量這種復制發生的速率。
最近發現秀麗隱桿線蟲中的基因復制率大約為10-7復制/基因/代，即在1000萬個蠕蟲的群體中，每一代將有一個基因重復。該速率比該物種中每個核苷酸位點的自發點突變率高兩個數量級。較早的研究報告認為細菌、果蠅和人類的基因復制速率范圍為10-3到10-7復制/基因/代。
