RIP 實驗基本原理：
? 用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。
? 防止非特異性的RNA的結合。
? 免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。
? 結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或 高通量測序（RIP-Seq）方法來鑒定。
延伸閱讀： 95%的人類基因組并不編碼基因，而是產生大量的非編碼RNA，真正編碼蛋白質的基因只占人類總基因組的約2%。這些非編碼RNA在生命的生長發育的各個階段都發揮著重要的調節作用，與艾滋病、白血病、糖尿病、畸形等多種病變密切相關，并且參與著干細胞和表觀遺傳學調控。而RNA-蛋白復合物驅動了幾乎所有細胞過程的基因表達的轉錄后調控，包括剪接（splicing）、出核轉運（nuclear export）、mRNA 穩定性以及蛋白轉譯過程，因此，對基因調控的了解就有賴于確定這些過程中RNA的結合的變化。因此，RNA研究也被越來越多的科學家重視起來，目前已經成為生命科學研究中一個炙手可熱的領域，而RIP技術也逐漸成為RNA研究領域的一項常規方法，幫助我們了解越來越受關注的轉錄后調控網絡。