色譜柱是HPLC系統非常關鍵的一部分,隨著色譜技術的發展,它也不斷地更新換代,長度變得越來越短,填料顆粒也越來越細。現在常用的色譜柱長度在30～250 mm,顆粒直徑在1.6～5μm。顆粒類型主要有全多孔和表面多孔,全多孔填料具有更大的柱容量、更多鍵合相選擇的優點,表面多孔具有反壓低、峰形好的優點。
最常用的基質是硅膠。以前填料純化技術不是很成熟,十八烷基鍵合到硅膠表面不是很完全,硅膠上總是少量的硅羥基裸露在外面。這樣就造成樣品在進行色譜分離的時候,會吸附或者鍵合在這部分硅羥基上,導致色譜峰拖尾。使用三乙胺作為封尾劑,先行與硅羥基吸附,可以使峰型改善,這個三乙胺曾經一度成為分析界的寶貝和機密。現在,制造填料的技術日趨成熟,人們已經掌握了把這部分剩余未鍵合硅膠也進行鍵合鈍化的技術,這個技術就叫作封尾。