一、原理
電泳遷移率分析，也可稱作遷移電泳，凝膠電泳分析，凝膠遷移率分析，條帶移動分析或者凝膠阻滯分析，這種方法常用來研究蛋白質-DNA，蛋白質-RNA的相互作用，對照泳道（不含蛋白質的DNA/RNA探針）將出現單一的條帶。如果蛋白質與片段結合，形成大的復合物，因此在凝膠上遷移的速度慢從來遷移率減低。
二、材料和試劑
1. DTT（Promega）
2. poly-dIdC（Sigma）
3. 32P-labeledprobe
4. BSA（Sigma）
5. 常用化學品試劑（Sigma）
6. 濾紙（GEHeathcare）
三、步驟
1. 制備聚丙烯酰胺凝膠
（1）裝配板，墊片，及夾具。用1%瓊脂糖封閉底部與側面，防止膠漏。
（2）5%聚丙烯酰胺凝膠的制備
| Platesize | Large | Medium |
| H2O | 78 mL | 39 mL |
| 10×TBE | 5 mL | 2.5 mL |
| 30%丙烯酰胺（19：1） | 16.6 mL | 8.4 mL |
| 10%過硫酸銨 | 1000 uL | 500 uL |
（3）混勻，盡量減少泡沫的形成。加100 uL/50 uLTEMED。
（4）混勻后倒入膠板，插梳子。凝膠聚合大概需10分鐘。
（5）聚合后，凝膠可用塑料膜包裹后4℃保存。
2. 制備5×結合緩沖液。
3. 結合反應
1 uL poly-dIdC（1ug/uLinTE）
2 uL 5x結合緩沖液
1 uL 標記探針
如有必要加1uL未標記的DNA探針片段（如競爭試驗）
0.1 uL 100xBSA
若干體積（uL）的核提取物（5ug總蛋白）
加H2O到10 uL 總體積
室溫孵育30分鐘。如有必要可再加入蛋白抗體，使阻滯更加明顯，加抗體后再室溫孵育30分鐘。
4. 在結合反應孵育的過程中，將膠裝在電泳槽，在0.5×TBE電泳緩沖液，150伏電壓下，預跑30分鐘，之后上樣，150 V 電泳2小時。
5. 制干膠（可選）：將膠轉移到濾紙上。膠上蓋濾紙，80℃真空干燥器中干燥1-2小時。
6. 壓片曝光在暗室中將膠放在暗盒中，放膠片。在-80℃條件下曝光。
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