依病禽、鳥等臨床上出現精神萎頓、結膜炎、脫水、消瘦、極度衰竭呈惡病質和排出綠色膠凍狀糞便，可作出初步判斷。剖檢發現脾、肝腫大，纖維素性氣囊炎，心包炎和腹膜炎，肺充血，腸管充血，則需進一步進行實驗室診斷。
我國對嗜衣原體的檢測方法主要有病原學檢查、血清學檢測和分子生物學檢測。
病原學檢查
病原學檢查是確診的重要方法，包括顯微鏡檢查和細胞培養法。病原學檢查陽性率不高（20%左右），需一定的技術及設備條件，同時應注意實驗室污染。
