十余年前，有人提出全世界有4億8千萬人感染有溶組織內阿米巴，以此推斷出其中4千8百萬人出現臨床癥狀，而且每年4萬至十萬人死于阿米巴病，這個死亡率在寄生蟲病中僅次于瘧疾和血吸蟲病居第三。已證實溶組織內阿米巴和迪斯帕內阿米巴是形態上相似的蟲種，但具完全不同的生理和病理特征，迪斯帕內阿米巴在腸道中生存的現象比溶組織內阿米巴常見得多，但只有溶組織內阿米巴為阿米巴病的病原體。迄今世界上仍有5千萬人感染溶組織內阿米巴，而迪斯帕內阿米巴感染人數卻為4.5億。據1988年~1992年調查，溶組織內阿米巴全國平均感染率為0.949%，估計全國感染人數為1069萬，感染率超過1%的共有12個省。其中西藏、云南、新疆、貴州、甘肅等5個省感染率超過2%，西藏感染率最高，達8.124%。
阿米巴病在熱帶和亞熱帶最常見，例如印度、印度尼西亞、撒哈拉沙漠和熱帶非洲，中南美洲，這個分布特點主要是氣候條件、衛生條件和營養條件差的結果。其他輔助因素則為高碳水化合物飲食、酒精中毒、遺傳性、腸道細菌感染或結腸粘膜局部損傷等。腸道阿米巴病無性別差異，阿米巴肝膿腫男性較女性多，可能與飲食、生活習慣和職業等有關，但是確切的原因有待探討。近年來，阿米巴的感染率在男性同性戀中特別高，在歐美國家中以迪斯帕內阿米巴存在為主，而在日本同性戀者中則以溶組織內阿米巴感染為主。但感染有人類免疫缺陷病患者阿米巴病的臨床癥狀與一般人群沒有多大差異。另外，患阿米巴病的高危因子，包括有旅游者、流動人群、弱智低能人群、同性戀者，而嚴重的感染發生在小兒尤其是新生兒、孕婦、哺乳期婦女、免疫力低下的病人，營養不良或惡性腫瘤的病人，長期應用腎上腺皮質激素的病人。但近年來感染情況并無統一報告，而且基于診斷手段和方法問題，準確性等無法評估。
另外，阿米巴病亦為獲得性免疫缺陷癥的常見合并癥，但并不增加嚴重感染的危險性。但有資料顯示，溶組織內阿米巴表面的凝集素可以促進人類免疫缺陷病毒的復制。
阿米巴病的傳染源為糞便中持續帶包囊的包囊攜帶者（cyst carrier or cyst passengers）。溶組織內阿米巴除了人感染外，犬、貓、豬、猴、猩猩等均有自然或可實驗感染，但作為保蟲宿主意義不大，人自身是重要的感染來源。包囊的抵抗力較強，在適當溫濕度下可生長數周，并保持有感染力，通過蠅或蟑螂的消化道仍具感染性。但對干燥、高溫的抵抗力不強。溶組織內阿米巴的滋養體抵抗力極低，并可被胃酸殺死，無傳播作用。人體感染主要是經口感染，食用含有成熟包囊的糞便污染的食品、飲水或使用污染的餐具為感染方式；食源性暴發流行則發生于不衛生的用餐習慣或食用由包囊攜帶者制備的食品；蠅或蟑螂的攜帶包囊也可造成傳播。另外，口-肛性行為的人群，糞便中的包囊可直接經口侵入，所以阿米巴病在歐美日等國家列為性傳染的感染（sexually transmitted disease STD），我國尚未報道，但應引起重視。