巨細胞病毒對人類的危害性很大，所以我們應積極預防其發生。
⑴進行有意識的身體素質的鍛煉。提高機體免疫機能及抗病能力，特別是育齡期婦女，以減少巨細胞病毒對胎兒的嚴重危害。
⑵對于孕婦或有慢性消耗性疾病、免疫力低下等患者要注意保護，使她們遠離傳染源。
⑶注意環境衛生、飲食衛生。
⑷乳汁中巨細胞病毒陽性者，不應哺乳。
⑸免疫防治，尚在研究和探索中。
CMV引起細胞內感染后，滅活疫苗無明顯預防的作用。懷孕早期發現有CMV原發感染及/或羊水細胞中有CMV抗原時，應中止妊娠。減毒活疫苗可使被接種者產生抗體。并產生對CMV的細胞免疫，減少癥狀性CMV感染的發生。CMV高價免疫球蛋白對血清CMV陰性的骨髓移植受者的癥狀性CMV感染，有一定的保護作用，但不能預防再感染。在接觸患兒尿液或唾液后應仔細洗手，以預防后天性CMV感染。
預防輸新鮮血引起的CMV感染，可用下列方法：①使用冷凍血液或經沖洗的血液；②血液輸入前須貯存48小時以上；③使用經放射線照射過的血液；④使用血液濾器除去血液中的巨細胞。