（1）感染，反復感染是免疫缺陷病最重要和常見的臨床表現，嚴重者可死于不可控制的感染。
（2）腫瘤，先天性免疫缺陷患者惡性腫瘤的發病率比常人高出100～300倍；由于腎移植時使用免疫抑制劑治療而導致繼發性免疫缺陷病的患者，惡性腫瘤的發病率比常人高出100倍。
（3）變態反應，由于免疫功能失調，免疫缺陷病患者中變態反應性疾病的發病率也比正常人高。
（4）自身免疫病，由于免疫功能障礙、失調，常同時導致自身免疫病的發生。從臨床情況觀察，繼發性免疫缺陷多發生在老年人，均為暫時性的，消除原始病因后，大多數能逐漸恢復。但嚴重者，如電離輻射和獲得性免疫缺陷綜合癥，有時可造成不可恢復的免疫缺陷。
（一）原發性免疫缺陷
1、B細胞缺陷
2、T細胞缺陷
3、補體蛋白缺損
4、吞噬細胞的缺損
（二）繼發性免疫缺陷
1、傳染性因子引起的免疫缺陷
（1）引起免疫器官的萎縮
（2）引起抗體反應下降：雞早期IBD
（3）引起全身抵抗力下降：雞貧血因子病
2、由藥物引起的免疫缺陷
3、由霉菌中毒引起的免疫缺陷
4、營養缺陷與免疫應答
5、AIDS
其最典型的臨床癥狀表現為反復感染或嚴重感染。由于遺傳因素或先天因素，使免疫系統在個體發育過程中的不同環節、不同部位受損所致的免疫缺陷病，稱先天性免疫缺陷病，或稱原發性免疫缺陷病。其中大多數與血細胞分化和發育有關，多發病于嬰幼兒期，嚴重者導致死亡。先天性免疫缺陷病種類很多，常分為抗體缺陷、補體缺陷、吞噬功能缺陷、聯合缺陷、T細胞缺陷等。因其他疾病和因素引起的免疫功能障礙稱繼發性免疫缺陷病。在臨床上較為多見。如感染、腫瘤、肝、腎功能不全、內分泌紊亂、免疫增生或其他慢性消耗性疾病都可引起不同程度的免疫缺陷。在腫瘤及器官移植時長期使用免疫抑制劑，亦可導致繼發性免疫缺陷。免疫缺陷病患者不能發揮正常的免疫應答和防御功能。