特征性的改變是補體尤其是C3和免疫球蛋白呈顆粒狀或帶狀分布，可顯示出小葉外周的輪廓，這與電鏡觀察到的內皮下免疫復合物沉積的部位相一致，沉積物的形態通常不如膜性腎病對稱，顆粒狀也沒有那么明顯。備解素及B因子呈相似分布。系膜的顆粒狀沉積可以明顯也可以不明顯。少數Ⅰ型可見免疫復合物沿小管基底膜和(或)腎小球外的血管沉著。沉積的免疫復合物的成分可有很大不同，可能反映了引起Ⅰ型的多種原因，大多數患者C3的沉積比任何免疫球蛋白都明顯；有一些以IgG或IgM為主；還有極少數以IgA為主，可以認為是表現為系膜毛細血管性腎小球腎炎的IgA腎病。早期起作用的補體成分如C1q和C4，比C3稍少見。少數病人可見毛細血管壁有Ig(尤其是IgM和IgG)呈節段性顆粒狀分布，偶爾也可見于系膜區。毛細血管腔內大量的免疫球蛋白和補體沉積形成球狀結構，這與光鏡觀察的透明血栓相一致，提示病變繼發于系統性紅斑狼瘡或者冷球蛋白血癥。